Nhà chưa hoàn công thường do 2 nguyên nhân chính là chủ nhà không làm thủ tục hoàn công hoặc chủ xây dựng không phép, trái phép nên không được hoàn công.
1-Trường hợp chủ nhà cũ không làm thù tục hoàn công:
a-Người mua chưa có quyền sở hữu nhà ở, vì vậy khi có quy hoạch, đền bù giải tỏa người mua chỉ được đền bù phần giá trị đất và giá trị nhà sẽ không được đến bù.
b-Khi hoàn công, người mua phải chi trả thêm các khoản phí, thuế hoàn công đồng thời thủ tục rất phức tạp.
c-Nếu nhà đã có giấy phép xây dựng nhưng đứng tên chủ sở hữu cũ thì ngoài các khoản phí và thuế thì điều kiện quan trọng nhất là cần phải có chữ ký của người chủ cũ, hay nói đúng hơn là cần sự hợp tác của chủ cũ. Nếu không hợp tác hoặc chủ cũ đã mất thì sẽ phát sinh thừa kế, khi đó được thì việc hoàn công sẽ rắc rối thậm chí không thể hoàn công được
d-Chủ cũ không thực hiện nghĩa vụ tài chính: nhiều chủ cũ không muốn thực hiện nghĩa vụ tài chính đối với Nhà nước nên đã bỏ luôn cả việc hoàn công nhà ở, gây ra không ít những hệ lụy là khi có nhu cầu bán nhà thì nhà bị giảm giá trị cả về pháp lý lẫn thực tế sử dụng.
e-Khi có nhu cầu vay Ngân Hàng thì Nhà chưa hoàn công sẽ không được định giá, mà chỉ định giá là đất mà thôi, vì vậy không thể vay được số tiền như mong muốn.